真核包括真菌和动植物,对于没有参考基因组的真核转录组研究,通过进行de novo基因组预测,并对预测所得转录本进行功能注释、SNP、SSR标记开发等分析。揭示其中转录活性较高的相关基因及其功能。一般而言,转录组具有不同的梯度的实验设计(如不同温度,不同添加物浓度等等),所以会有多个转录组进行比较分析,从而揭示与研究的功能(表象)具有一定联系的基因(簇)或代谢途径(机制)。
无需了解物种的基因或基因组信息,便可直接对任意物种进行最全面的转录组分析
可检测未知基因,发现新的转录本
从实验方案设计到分析报告解读,提供全方位的售前售后服务
Total RNA
mRNA片段化
cDNA合成
文库构建
上级测序
动物组织>2g;植物组织>4g;菌体>2ml(密度约106-108 个/ml,对数期或稳定初期,OD600约0.6-0.8),菌液离心除去培养基;血液样品>2ml。菌体及动物组织可用RNA保护剂(菌体/组织体积:RNAlater=1:5)处理或液氮冻存后保存
浓度≥50ng/μl,总量≥1μg(单次建库),OD260/280介于1.8~2.2之间,OD260/230≥2.0,RIN值≥6.5,动物28S:18S≥1.0,植物25S:18S≥1.0,菌体23S:18S≥1.0,确保RNA无降解
浓度≥10ng/μl,总量≥2μg(单次建库),RIN值≥6.5,OD260/280介于1.8~2.2之间
HiSeqPE150
6G~12G
50个工作日